名偵探柯南：江戶川柯南失蹤事件~史上最糟糕的 (名探偵コナン 江戸川コナン失踪事件 〜史上最悪の2日間〜)

(2014)江戶川柯南、灰原哀與毛利蘭三人到澡堂泡澡，柯南在男澡堂的更衣室發現兩名可疑的男子，接著在浴池不慎滑倒暈厥。說要開車送柯南去醫院的，是柯南方才看到的可疑男子龍(草尾毅)與近藤(香川照之)，柯南也因此發現，這兩個人是秘密社會裡的有名人物，來到澡堂是要執行秘密任務。

聽說柯南被送往醫院的小哀與毛利蘭，四處在附近的醫院尋找，卻始終找不到柯南。就在此時，毛利蘭的手機卻收到「傷口並無大礙，不用擔心。跟認識的大哥哥一起去吃飯了。」的郵件，而發信方竟是柯南帶著的新一的手機。

在那之後，香苗(廣末涼子)為了調查丈夫的外遇，而來到毛利小五郎的偵探事務所。香苗拿出之前在萬事屋工作的丈夫的照片，居然就是近藤！而香苗卻對丈夫在秘密社會裡工作相關的事情一無所知。

另一方面，近藤與一幫不知道幕後黑手是誰的隊友們一起執行任務。他們的任務就是要襲擊知名人物，利用炸彈引發恐怖事件，且他們居然要利用失去記憶的柯南？

操縱著闖空門專家、天才詐騙高手、傳說殺手等各種犯罪者的人到底是誰……在複雜的人物與事件交錯之中，案件背後隱藏的真相到底是……