魔法科高校的劣等生

故事發生在二十一世紀末，彼時，魔法早就已經不再僅存與神話和傳說之中，而是同科學與超能力融合，成為了人盡皆知的存在。國家甚至成立了魔法大學附屬第一高校，專門培養此方面的人才，以便更好的為國家效力。

司波達也(中村悠一配音)和妹妹司波深雪(早見沙織配音)是魔法高校的新生，深雪是能力優秀的“花冠”，而達也則是作為其替補的二科生“雜草”。在學園中，兄妹兩人結識了許多有趣的同伴們——個性大大咧咧不拘小節的千葉艾麗卡(內山夕實配音)、文靜膽小的柴田美月(佐藤聰美配音)、正直勇敢的西城雷歐哈魯特(寺島拓篤配音)、認真努力的吉田乾比古(田丸篤志配音)，在學習的過程中，存在於學園之中的秘密也在逐漸揭曉。